Welcome to Home page of EbolaVCR



Ebola Virus Computational Resources (EbolaVCR) is the in silico resources developed to facilitate scientific community fighting against deadly virus EBOLA. This server enlists possible vaccine candidates, therapeutic siRNAs and other related resources.
Reference: Dhanda et. al. (2016) A web-based resource for designing therapeutics against Ebola Virus. Sci Rep. 6:24782.
AntigenVP40
StrainBundibugyo Ebola Virus (BDBV)
Number of strain5
Gene IDgi_302371216
Protein IDYP_003815434.1
Mapped EpitopeVisualize
Sequence conservationVisualize Alignment
IDstartPeptideCTLMHC I allelesMHC I allele CountHLA allelesHLA allele Count MHC II allelesMHC II allele CountB cell epitopeInterferon-gamma inducerInterleukin-4 stimulator
4227Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)174 FDLTALKLI NHLA-A2.1, HLA-B*3701, HLA-B*4403, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B61, MHC-Db, MHC-Kk9NA0DRB1_0701, DRB1_07032N-0.99
4262Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)209 FHPKLRPIL NHLA-A2.1, HLA-B14, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-Cw*0602, MHC-Db, MHC-Dd11NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1302, DRB1_13238N-0.99
4126Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)73 FILEAMVNV YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-B*51, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B*54018HLA-B*5301, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04265N-0.99
4296Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)243 FLQDLKLVP NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_11078N-0.57
4210Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)157 FLQEFVLPP NHLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B*51, HLA-B*54014NA0DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04263N-0.77
4225Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)172 FTFDLTALK NHLA-A*1101, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-A68.1, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*54017NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0408, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_110711N0.06
4214Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)161 FVLPPVQLP NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0408, DRB1_1120, DRB1_13025N-0.62
4346Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)293 IGMDPISQG NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0421, DRB1_11079N0.32
4337Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)284 IIPILLPKY NHLA-A3, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B62, HLA-Cw*0602, HLA-Cw*07026NA0DRB1_03011N-0.26
4340Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)287 ILLPKYIGM NHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2, HLA-A3, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B62, HLA-B8, HLA-Cw*0301, MHC-Kb11NA0DRB1_1501, DRB1_15062N-0.30
4311Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)258 IMGIEVPEL YHLA-A*0201, HLA-A*0205, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B7, HLA-Cw*0401, MHC-Db revised11HLA-A*0203, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_132115N-0.03
4338Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)285 IPILLPKYI NHLA-B*0702, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B7, HLA-Cw*0401, MHC-Db, MHC-Kd, MHC-Kk, MHC-Ld15NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_01058N-0.23
4145Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)92 IPIWLPLGV NHLA-B*0702, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B61, HLA-B7, HLA-Cw*0401, MHC-Ld13NA0DRB1_0402, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1305, DRB1_1311, DRB1_1322, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_150615N0.63
4290Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)237 IQAIMNFLQ NNA0NA0DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB5_0101, DRB5_010511N-0.60
4260Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)207 ISFHPKLRP NNA0NA0DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_132811N0.83
4128Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)75 LEAMVNVIS NHLA-B*3701, HLA-B40, HLA-B*4403, HLA-B61, MHC-Kk5NA0DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_04269N0.41
4300Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)247 LKLVPIDPA NHLA-A2, HLA-A20 Cattle, HLA-B*0702, HLA-B*514NA0DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_11075N-0.09
4341Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)288 LLPKYIGMD NHLA-A2.11NA0DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_08175N-0.37
4202Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)149 LLRIGNQAF YHLA-A3, HLA-B*0702, HLA-B*2702, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B626HLA-A*0301, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0110DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0701, DRB1_0703, DRB5_0101, DRB5_010514N0.16
4319Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)266 LLVHRLTGK NHLA-A*1101, HLA-A20 Cattle, HLA-A3, HLA-A*3101, HLA-A68.1, HLA-B*27056NA0DRB1_1102, DRB1_1121, DRB1_13223N0.06
4141Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)88 LMKQIPIWL YHLA-A*0201, HLA-A2.1, HLA-A3, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3501, HLA-B*3701, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B7, HLA-B8, HLA-Cw*0602, MHC-Db revised13HLA-B8, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, HLA-B35, Mamu-A*0111DRB1_0101, DRB1_01022N0.10
4342Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)289 LPKYIGMDP NHLA-B*511NA0DRB1_15061Y-0.30
4221Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)168 LPQYFTFDL NHLA-A*0201, HLA-A2, HLA-A2.1, HLA-B*3501, HLA-B*3801, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B60, HLA-B7, HLA-B8, HLA-Cw*0401, HLA-Cw*0602, HLA-Cw*0702, MHC-Dd, MHC-Kb, MHC-Ld21NA0DRB1_1501, DRB1_15062N-0.33
4211Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)158 LQEFVLPPV NHLA-A*0205, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*51, HLA-B*5201, HLA-B626NA0DRB1_15061N-0.98
4203Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)150 LRIGNQAFL NHLA-A2.1, HLA-B14, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3701, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised12NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0806, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_150613N0.37
4200Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)147 LRLLRIGNQ NHLA-B14, HLA-B*27022NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB5_0101, DRB5_010540N0.44
4256Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)203 LRPGISFHP NHLA-B*27021NA0DRB1_0301, DRB1_0402, DRB1_1107, DRB1_1501, DRB1_15065N0.99
4266Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)213 LRPILLPGK NHLA-B*2702, HLA-B*27052NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_010517N0.60
4324Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)271 LTGKKITTK NHLA-A3, HLA-A68.12NA0DRB1_08131N-0.37
4320Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)267 LVHRLTGKK NHLA-A*1101, HLA-A3, HLA-A68.13NA0DRB1_0402, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_13078N-0.15
4302Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)249 LVPIDPAKN NNA0NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0801, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1128, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB5_0101, DRB5_010521N0.06
4185Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)132 LVRINRLGP NNA0NA0DRB1_0102, DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1102, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1114, DRB1_1120, DRB1_1121, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1302, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1322, DRB1_1323, DRB1_1327, DRB1_1328, DRB1_1501, DRB1_1502, DRB1_150637N-0.19
4312Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)259 MGIEVPELL YHLA-A24, HLA-B*3501, HLA-B*3701, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B40, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B60, HLA-B7, HLA-Cw*0301, MHC-Db, MHC-Db revised, MHC-Dd, MHC-Kd20HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_04265N0.54
4169Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)116 MLASYTITH NHLA-A2.1, HLA-A32NA0DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_132115N-0.44
4095Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)42 MMSDTPSNS NNA0NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_0401, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_110711Y0.25
4073Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)20 MRTVSTSIN NHLA-B*2702, HLA-B*27052NA0DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_08066N-0.18
4096Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)43 MSDTPSNSL YHLA-A1, HLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*3902, HLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*5801, HLA-B60, HLA-Cw*04019HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0701, DRB1_07032N0.14
4131Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)78 MVNVISGPK YHLA-A*1101, HLA-A3, HLA-A68.13HLA-A*2402, HLA-B14, HLA-B*51, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, HLA-B*2706, Mamu-A*0113DRB1_0404, DRB1_0408, DRB1_0423, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB5_0101, DRB5_010513N-0.17
4321Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)268 VHRLTGKKI NHLA-B*3801, HLA-B*3901, HLA-B*51, MHC-Kk4NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB5_0101, DRB5_01054N-0.11
4134Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)81 VISGPKVLM NHLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*53013NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0309, DRB1_0311, DRB1_11078N-0.99
4140Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)87 VLMKQIPIW YHLA-A3, HLA-B*2702, HLA-B*51, HLA-B*5801, HLA-B625HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1102, DRB1_1114, DRB1_1121, DRB1_1304, DRB1_1322, DRB1_132312N0.04
4094Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)41 VMMSDTPSN NHLA-A2.11NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0401, DRB1_0405, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0426, DRB1_1107, DRB1_130410N0.23
4132Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)79 VNVISGPKV NHLA-B*51, HLA-B*5102, HLA-B613NA0DRB1_0101, DRB1_01022N0.12
4303Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)250 VPIDPAKNI NHLA-B*0702, HLA-B*3501, HLA-B*51, HLA-B*5101, HLA-B*5102, HLA-B*5103, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5401, HLA-B7, HLA-Cw*0401, MHC-Db, MHC-Kd, MHC-Kk, MHC-Ld15NA0DRB1_0301, DRB1_0306, DRB1_0307, DRB1_0308, DRB1_0311, DRB1_11076N-0.11
4219Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)166 VQLPQYFTF YHLA-A1, HLA-B*2702, HLA-B*2705, HLA-B*3902, HLA-B*4403, HLA-B*51, HLA-B*5201, HLA-B*5301, HLA-B*5801, HLA-B62, HLA-Cw*0301, MHC-Ld12HLA-B14, HLA-B27, HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*0111DRB1_1501, DRB1_15062N-0.31
4186Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)133 VRINRLGPG NHLA-B14, HLA-B*27022NA0DRB1_0301, DRB1_0305, DRB1_0309, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1107, DRB1_1128, DRB1_1301, DRB1_1304, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1327, DRB1_132821N-0.08
4122Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)69 VSSAFILEA YHLA-B*51, HLA-B*5301, HLA-B*58013HLA-Cw*0401, H2-Db, H2-Dd, H2-Kb, H2-Kd, H2-Ld, HLA-G, H-2Qa, Mamu-A*019DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_13114N0.29
4070Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)17 VYPMRTVST NHLA-A24, HLA-Cw*0401, MHC-Dd3NA0DRB1_0101, DRB1_0102, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0421, DRB1_0423, DRB1_042611N0.02
4345Bundibugyo Ebola Virus (BDBV)292 YIGMDPISQ NHLA-B*51, HLA-B*54012NA0DRB1_0101, DRB1_0305, DRB1_0401, DRB1_0402, DRB1_0404, DRB1_0405, DRB1_0408, DRB1_0410, DRB1_0423, DRB1_0426, DRB1_0801, DRB1_0802, DRB1_0804, DRB1_0806, DRB1_0813, DRB1_0817, DRB1_1101, DRB1_1104, DRB1_1106, DRB1_1114, DRB1_1128, DRB1_1305, DRB1_1307, DRB1_1311, DRB1_1321, DRB1_1323, DRB5_0101, DRB5_010528N0.14